初任西域都护，是元帝时，因他为官忠厚
民，深受西域各族人民敬仰，其威信更是令人信服。后来三年任
，段会宗奉调还朝，又先后担任过沛郡、雁门两任太守，政绩斐然。在此期间，西汉朝延派出几任西域都护无功而还。后来，西域诸国连连上书，多次请求汉帝再派段会宗担任西域都护一职。
及至成帝时，为了
足西域诸国的愿望，便在
朔年间，再次派遣段会宗赴西域都护府主持军政事务，那时，段会宗已年逾花甲。他头发花白，却依旧风尘仆仆，翻越千山万水，出了玉门关，走马上任。
段会宗是个好大节，矜功名的人。
他一辈子都兢兢业业，不求闻达，但求问心无愧，第二次出任西域都护时，好友谷子云曾赠言与他，劝他不要太过
劳。然而，他生
就是个勤政民的好官，在任上，依旧是兢兢业业，丝毫不敢懈怠。因为是这样一个一心为民的好官，所以当他再为西域都护，人还没到，西域各国便已沸腾。
他的车队一进入西域，所过之处，各国国王都派遣子弟出城数十里前去相
。乌孙国的小王安
，竟然走了千里之遥，亲自从伊犁河畔赶到
兹接。段会宗一路上，每到一座城郭，国王和城主都十分热情地接待他，谈笑之间，皆融洽和谐。他每到一处，就抚官恤民，了解风土人情，以及城郭诸国的相互关系。成为各城郭之间紧密联系在一起的纽带与协调者。
西域的事物，十分复杂。其间盘|踞着多方势力，西域都护的差事，并不好当，稍有不慎，就很有可能会引发争端，引来冲突与战争。
当时的西域
传着一句话，说：“没有张骞说不通的人家，没有段子松摆不平的矛盾。”这话，足以看出段会宗在西域各国中的威望了！
然而，即使是段会宗，也有栽跟头的时候。
事情还要从他第二次上任西域都护之初说起。
当时，段会宗再次出任西域都护的消息传到了康居，康居国的太子保苏匿又是高兴又是惭愧。他因自己曾一度受匈奴人的威
而反对过汉朝的事，
到十分不安。但他坚信段会宗是一位值得信赖的都护，因此他果断地采取了行动，亲自率领数万人来归顺汉朝。于是，段会宗就派遣他的属下卫司马，带领人马前去
接受降。谁知，派去的这位司马原来是个胆小之徒，当他一见到来投降的保苏匿带了这么多人马前来，竟因为害怕局势失控，就直接命令保苏匿把自己的手下互相捆绑了起来。
这种举动十分荒唐。
保苏匿一见，顿时大为失望，于是就带着自己的部下逃走了。
很快，朝|廷知道了这件事，成帝并没有去了解事情的始末，而是不分青红皂白，直接将罪责怪到了段会宗的头上，罢了他的都护之职，将他调回去担任金城太守。因为这件事，段会宗大受打击，大病了一场，直接未能赴任。
报应来得很快。
一年之后，西域的乌孙国又出事了。他们的小王安
被自己人杀害，诸翎侯争权夺势，国内大
。这件事很快从乌孙一家之事，演变成了地区纷争，西域多方势力都牵扯其中，矛盾愈演愈烈，局势愈发紧张，朝|廷一连派了几位都护，都无法平息这场
子，最终无奈，只好再一次起用段会宗。为了托付稳定西域重任，成帝拜段会宗为光禄大夫、中郎将作为安抚。
当时的段会宗，已经是一个七十多岁的老人了，尽管上次受到了不白之冤，但为了山河稳定，他却仍忍辱负重，顾全大局，不计较个人恩怨，不顾老迈年高，鞍马劳顿，毅然决然地再入西域，前往乌孙！
可以说，段会宗是将自己的一生都献给了西域，献给了这一方水土！
最终，他果然利用他的威望与智谋，经过多方调停，终于达成了协议，立安
的弟弟末振将为乌孙小王，这才平息了一场纷争战。然而，好景不长，因乌孙有大小两个王国。这两个王国矛盾频发，经常为了地盘纷争大打出手。新继任的乌孙小王末振将为了巩固自己的地盘，就来个先下手为强，派人以诈降之计把乌孙大王给刺杀了。
坏人命不长，很快，末振将自己也得病死去。
他一死，乌孙的大小王国，就陷入了更大的危机和混
之中……成帝得到这个消息，又要派遣段会宗发西域兵马去乌孙问罪。
段会宗接到命令，觉得不妥，因此并没有照做。
他认为如此兴师动众，既扰
乌孙的安宁，又容易走漏风声，甚至可能把末振将的继承人，太子番丘惊跑。因此，他把大队人马留在后面，只挑选了三十名
壮的弓箭手，亲自进了乌孙王城赤谷，在一天之内，设计除去了番丘，重立了一位小王，然后又还乌孙大王以公道，再一次将乌孙内暂时平定了下来。后来，当段会宗把这件事的始末奏明天子，朝中大臣议论纷纷，大家都说段会宗智勇双全，以轻兵深入乌孙，既诛叛逆，又显国|威，应该重赏，于是皇帝下诏，封段会宗为关内侯，赐黄金万两。
然而，虽然有段会宗这尊大佛镇守，西域的糟心事还是一样没完没了。
没过多久，乌孙小王的叔父，又笼络了一帮子人要谋害乌孙大王，这一闹，很快又闹成了地区
的事件。成帝听说后，又派段会宗第三次前往，与当时的新都护孙建协同处理。
当时，段会宗已经七十好几了，都说“人生七十古来稀”，在那个年代，他这个岁数还这么奔波的，真的是绝无仅有了！
终于，在这样的
劳与奔波下，第二年，段会宗积劳成疾，病死在了乌孙，终年七十五岁。他去世的噩耗传到了天山以南。城郭诸国居民，无不唏嘘，为
念他几十年如一为西域的安定呕心沥血，他们纷纷自发给他发丧举哀，修建祠堂纪念他的功德。也就是在那一年，西域都护府里，突然长出了一棵白桦树，那树无人栽种，一夜长大，就立在段会宗住过的那个院子里，正对着他的窗前。
大家都说，那是段会宗心里舍不下西域百姓，故而化身为白桦树，永远了留在了西域，留在了这一片土地之上……
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